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深企自主研发技巧刷新基因检测速度_深圳消息_南方网

2018-01-24 03:58

  随同着基因测序技术的快捷发展,基因数据的天生浮现指数级增加,对检测速度和分析才能也提出更高请求。22日,记者从深圳承启生物科技有限公司(以下简称“承启生物”)获悉,近日该公司的云计算平台搭载自主研发的FANSe三代算法,首次实现1分钟解析近2万个基因信息,比以往的同类技术快了数十倍。这一技术冲破预示着基因检测的速度和成本将实现质的奔腾。

  检测速度提高数十倍

  每个人的基因组都由60亿个碱基组成,编码着2万多个基因,人的生老病逝世都在这些基因序列之中,因而精准医学的基础就是大规模基因组测序。随着大规模测序技术的疾速提高,测定全体2万多个基因的序列最快只有多少个小时,但解析这海量基因数据在以往却须要以天来计算。为了防止“测序5分钟,运算两小时”的为难,人们此前的解决措施无外乎是动用超级盘算机,或者研发专用的加速芯片来加速,但由此带来了本钱昂扬、机动性差、正确度不高的问题,饱受医学界诟病。

  为了攻克这一困难,承启生物用了3年时间,完整自主研发了高精度的FANSe第三代算法以及测序数据分析云平台,在58秒内将一个人近2万个基因的上亿碱基信息解析一遍,刷新了世界纪录。“咱们与天河二号超级计算机配合,13亿人的基因信息全算一遍也就十来天的工夫。”FANSe算法的开发者张弓教学说,无需任何加速芯片的特色使得这套方案很轻易推广。

  在国际期刊发表论文

  承启生物开发的这套系统不仅快得惊人,还大幅度进步了精确度。张弓先容,44期香港本港台现场开奖,算法设计伊始,他就定下了一个刻薄的目的,“分析误差在任何情形下不得超过一亿分之一,超出所有传统算法。”大批试验验证表明,FANSe系列算法在DNA渐变分析、RNA表白分析等运用上,准确度简直为100%,秒杀国外基于BWA、Bowtie等算法的方案,并在医学研究和临床实际中积聚了众多成功案例。

  2017年11月,承启生物就已经在国际核酸科研范畴的顶级期刊、英国《核酸研讨》杂志上发表论文,用这套体系胜利实现了人类全转录组的秒级剖析,即在1秒多的时光内分析实现人类全转录组测序数据,并向全世界科研职员免费开放。

  累计分析超50万例样本

  跟着基因测序技巧跟迷信的发展,医学医治正逐渐向个性化的精准医学时期迈进。

  精准医学是一种私家定制化的医疗模式。它以人体基因组信息为基本,联合蛋白质组、代谢组等相干内环境信息,为患者量身定制最佳治疗方案,包含用药计划等,以期到达治疗后果最大化和副作用最小化。

  记者懂得到,承启生物的这一高速分析云平台已在医学科研和临床利用中累计分析超过50万例样本,用于查找常见沾染疾病病因、为晚期癌症病人找到适合的药物等。“1分钟可分析近2万个基因信息,象征着未来大范围测序的分析将不再是瓶颈。”张弓以为,在这些新技术的辅助下,未几的将来,人们做基因检测将变得更加便利快捷、价廉物美,全民精准医学时代将为期不远。

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